公曆2056年,地球爆發毀滅性核戰爭,人類大規模滅絕,地球生態係統被嚴重破壞,地球文明接近毀滅。人類DNA遭遇不同程度的核輻射影響,導致不規則變異,這些史無前例的影響沒有帶來人類的集體進化,而是誘發了各種各樣的疾病、癌症和難以記述的肢體異變。存活下來的人類一方麵承受著惡劣的自然災害,一方麵遭受著生理上的折磨,直至一位絕望的人類學者向宇宙發出求救信號。
公元2133年,來自編號39704銀琴星係的外星人來到地球,它們利用先進的星際科技幫助地球重建生態係統,為了讓人類得以延續,他們在與人類領袖溝通之後對人類基因進行了改造,一組全新的AO染色體被嵌入到原始的人類DNA中,取代了XY染色體以進行生殖延續,曆經近三個世紀的適應、融合、重組、分化,新的ABO性彆在人類新社會中穩定下來。
公元2998年,地球文明完成重建,三個大陸板塊被保留下來,分彆是位於北半球極光大陸、東半球的星海大陸和南極洲的極晝大陸,它們成為人類文明的新據點。
公元3013年,銀琴星人離開了地球,回歸遙遠的大聖海,故事開始。