這次的聯合行動可以說是空前成功，但紅方並不打算到此為止，他們的目的是抓到黑衣組織的Boss，從而一舉殲滅！

在抓到哥薩克後，安室透立刻對他進行了審問，雖然對方打算咬死不什麼都不說，但幾個回合下來，就讓安室透從他的話中獲取了關鍵信息：Boss確實來了日本，目前人在鳥取，而碼頭那邊的某個貨船則是東京這邊的巢穴，顧分頭行動。

FBI、CIA和日本警視廳負責東京這邊的行動，MI6由於傷亡較嚴重，則負責後方支援，而鳥取那邊由鬆本管理官親自帶隊負責追擊。

這邊星河酒店的眾人，在目暮警官的護送下終於到達一樓。直到看到外麵的世界一片安靜，懸著的一口氣終於落下。當園子看見小蘭和京極真都沒事時，遠遠的跑了過來先是緊緊抱住京極真，又按捺不住的哭著抱著小蘭：“小蘭，你可擔心死我了！”

而妃英理在看到父女倆平安無事時，也抑製不住的哭了起來，小五郎立刻心疼的跑過去哄她：“英理，你看，我的胳膊腿都在呢，小蘭這次也是，我把她毫發無傷的帶出來了！”

小蘭隻能安撫好園子後，又跑過來安撫媽媽，就在這時，她看到茱蒂老師和諸星大的車開了過去，“他們為什麼會在一起？”，然後後麵跟著的是佐藤警官和高木警官的車，而後排坐著的正是真正的工藤新一！

雖然警察一直說不要走出酒店的範圍，外麵也許還有伏擊，但這一刻，她管不了那麼多，追逐新一是她的本能。

工藤新一曾對佐藤警官說過，事情不平息之前不要讓小蘭他們過多的介入，所以當她看到小蘭後並沒有停車而是繼續向前開，但高木警官卻心疼的說：“回去吧，佐藤警官，倒回去。”

“你說什麼？！出了事情可怎麼辦？”

“倒回去吧，美和子，讓他們好好的告彆。”佐藤警官突然想到了什麼，倒車停在了小蘭麵前。

身後是來追小蘭的毛利小五郎，前麵是做好掩護的赤井秀一和高木警官，新一探出車窗，一把摟過小蘭的脖子，狠狠的吻著她嘴唇，如同永彆一般！

這樣的訣彆之吻，使她想起來了！那個著火的倉庫！那個她忘了的真相！

決戰在碼頭的一艘廢棄大船上，最先殺出來的是黑方的雇傭軍。散彈槍、火箭炮、手榴彈開路，在日本警方的頑強抵抗下，雙方幾乎戰成平手。

趁著警方被雇傭軍帶走的空隙，勃艮第坐著改裝過的吉普車，在槍林彈雨中衝出來！

安室透說的沒錯，勃艮第是個瘋子，無數的手榴彈像下雨一樣被扔出來，他似乎從來不考慮會不會炸到自己人，也可能在他的意識裡根本沒有自己人！而更可怕的是，不知什麼時候還跑出來了幾家直升機為其開道和斷後，其中一家直升機裡的人跟勃艮第一樣瘋狂，一樣無差彆的掃射！但具體是誰並不清楚。

佐藤警官的車技一直是警視廳最好的，所以今天的任務和高木警官一起跟緊黑衣組織的車，而工藤新一是在解決炸彈問題後加入的，可是現場的情況實在太過混亂，佐藤警官被流彈射到肩膀，差點導致翻車！高木警官立刻將佐藤警官安頓給了托馬斯，由他負責繼續駕車追尋！

警方及時調整了戰略，改派直升機和高射炮進行攻擊，終於減少了警員的犧牲，其中一台高射炮由安室透親自操作，他打掉了好幾個黑方的直升機，剩下的也趁機逃跑。

勃艮第的車朝著碼頭出口處一路狂奔，在就要出去時，CIA的莎倫突然開著卡車向勃艮第的汽車撞去，車上的人看到她後，立刻瘋狂射擊，莎倫就這樣殉職了，其實從尼爾森告訴她看到勃艮第的時候，她就決定了這一切！雖然她的生命已經終結，但她的腳並沒有鬆開，全速滿載的卡車撞翻了勃艮第的吉普車，而她自己駕駛的卡車也發生側翻。

強烈的撞擊，使得勃艮第和他的兩個手下暈過去了一會，這就給高木警官和新一追上來的機會，雙方立刻展開激戰！

高木警官如同神兵天降，他的槍法非常好，判斷也很準確，手槍裡的子彈一發都沒有浪費，在勃艮第扔出最後兩個手榴彈後，再無力抵抗，最後無力的跪倒在地！

高木警官拿出手銬正準備逮捕勃艮第，卻不想遠處出現了一架直升機，裡麵的人打算搶先處決他，一把步槍準確的瞄準了勃艮第的鼻子，扣動扳機！子彈擊出時高木警官就有所感應，竟用自己的身體擋住了這致命一擊！

“琴酒！”他居然趁亂登上了一架直升機！旁邊還有基安蒂和科恩，可他們都知道，這場處決是琴酒一個人的遊戲！

新一在亂槍中飛身將高木警官護在身下，竭儘全力將他拖到車後麵，而勃艮第也在抱頭亂竄，好在琴酒的首要目的是將勃艮第滅口，海邊的風力也夠大，這使得新一和高木警官有了喘息的機會，而勃艮第也被槍擊中大腿倒地。

終於等到了另一架直升機的出現！赤井秀一一槍打中了琴酒的帽子，但同樣因為距離太遠，他無法真正命中！琴酒大怒，“他居然還活著，明明我上次擊中了他的胸口！”

兩架直升機在空中發生了激烈的對擊，但都沒有擊中要害，琴酒和赤井秀一都透過瞄準鏡死死的盯著對方，直到直升機不斷拉遠，超過了對勃艮第的擊殺距離，最後，琴酒有些遺憾的說：“撤退吧。”

然而，這個世界隻有赤井秀一知道，今天，是琴酒他放過了工藤新一！

新一看著遠去的直升機鬆了一口氣，卻發現高木警官身上不僅這一個彈孔，他早就中槍了！“高木警官，是什麼時候！“他突然想到，在把佐藤警官抱下車時，他好像聽見高木警官低聲哼了一聲，”難道你在那個時候也中了流彈？！”真不敢相信，他剛才還進行了那樣的搏殺！

高木警官失血過多，雙眼開始模糊，“柯南，幫我跟美和子說…說聲抱歉，我…也沒能…”便暈死了過去。

鳥取，鬆本管理官帶人在一家可疑的藥品公司遭到了埋伏，幸好大阪輔警再次及時趕到，雖然危機解除了，卻沒有抓到Boss。